山東-青島多組學聯合網絡藥理學、分子對接及實驗驗證
時間:2023-04-26 09:00 至 2023-04-28 17:00
地點:線上活動
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山東-青島多組學聯合網絡藥理學、分子對接及實驗驗證 已截止報名課程時間: 2023-04-26 09:00至 2023-04-28 17:00結束 課程地點: 線上活動 會議規模:50人 主辦單位: 北京創科鴻達科技信息技術有限公司
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會議通知
會議內容 主辦方介紹
山東-青島多組學聯合網絡藥理學、分子對接及實驗驗證宣傳圖
【會議簡介】
本次學習班課程將結合《網絡藥理學評價方法指南》,以最簡單易懂的方式介紹復雜疾病和中藥復方研究所用到的網絡生物學的數據、方法和技術,并以中藥復方解析的工作流程為線索,講授如何一步一步地研究復雜疾病和挖掘中藥復方的作用機制。課程內容全面覆蓋網絡藥理學的數據獲取、數據分析和可視化、驗證實驗設計、論文撰寫、課題設計、基金申請等內容。本學習班全部采用免費數據庫和在線分析工具,學員不需要編寫程序。
*本次學習班全程電腦實戰教學,90%以上為上機指導操作,無繁瑣的理論授課,做到課程學完,就能獨立分析中藥復方。老師將長期在學習群解答學員問題。
【會議時間】
2023年4月26日上午9:00—12:00 ;下午14:00—17:00
2023年4月27日上午9:00—12:00 ;下午14:00—17:00
2023年4月28日上午9:00—12:00 ;下午14:00—17:00
【參會方式】
線下授課,山東青島
【會議大綱】
網絡藥理學基礎知識和數據獲取
(一)網絡藥理學基礎知識
1.?網絡藥理學的發展歷程和經典文獻介紹
2.?分析網絡藥理學SCI論文3篇,解析數據分析要點和論文寫作模式
3.?網絡藥理學的核心問題和研究流程
(二)網絡藥理學數據獲取
???1. 中藥有效成分以及對應靶點的查找和獲取。
(1)?使用中藥數據庫獲取中藥有效成分、進行ADME篩選、獲取化合物的靶標
(2)?用化合物信息數據庫獲取中藥小分子的結構、ADME信息、靶標
(3)?用蛋白質信息數據庫進行靶蛋白的名稱、ID轉換
(4)?用化學相似性預測化合物靶點
(5)?基于藥效團模型的藥靶預測
(6)?用QSAR模型預測化合物靶標
2.?中藥治療疾病相關基因的獲取
(1)?在OMIM, DisGeNet,Genecards查找和獲取中藥所治療疾病的相關基因
(2)?使用西藥數據庫獲取治療某種疾病的西藥和對應靶標
(3)?GEO數據庫中獲取疾病相關基因芯片數據并進行差異表達分析
?網絡藥理學的數據分析和可視化
1.?分子對接:?
(1)PyMol軟件介紹
l?蛋白對象的操作、展現、隱藏、標記、測量
l?分子對接結果的美化展示
l?配體-受體結合位點可視化分析工具介紹
(2)用AutoDock Vina軟件進行分子對接,包括一對一對接和多對多對接
2. 組學數據及中藥靶點的功能富集分析(包括基因、代謝物、以及基因-代謝物的聯合功能富集分析等)
3. 基于基因表達譜數據用CMAP分析藥物作用機制
4. 基因關聯網絡、基因共表達網絡的構建
網絡藥理學數據分析、驗證實驗設計、研究案例、課題設計
1.Cytoscape軟件的詳細講解:網絡構建、分析、美化?
(1)?靶標網絡、疾病網絡構建和分析
(2)?藥物-靶標相互作用網絡構建和分析
(3)?藥物-靶標-通路網絡的構建和分析
(4)?代謝物網絡的構建與分析,基因-代謝物關聯網絡的構建,代謝組與轉錄組/蛋白組/網絡藥理學聯合分析
(5)?網絡拓撲特征的計算;網絡拓撲指標的含義;重要節點識別;模塊分解;網絡可視化和美化;Cytoscape插件的安裝和使用等
2.?網絡藥理學常用圖形繪制
維恩圖、通路富集圖等的繪制
3.?網絡藥理學驗證實驗設計
4.?網絡藥理學相關學術期刊介紹
5.?網絡藥理學SCI論文寫作和高分文章解析
6.《網絡藥理學評價方法指南》解讀
7.?網絡藥理學相關的項目設計解析
【參會費用】
1.參會費用:3980/人??砷_具報銷發票及會議通知。
2.團體5人以上報名,可免費贈送一個名額
*備注:實際授課時還會增加一些報名學員反饋的針對性問題。另外自備筆記本電腦,安裝WINDOWS 10操作系統及Office Excel 2010等軟件。
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