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    首頁 > 培訓課程 > 學術/科研培訓 > R語言生信數據分析及可視化作圖(網絡)研討會2023年1月 更新時間:2022-11-16T16:18:16

    R語言生信數據分析及可視化作圖(網絡)研討會2023年1月
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    R語言生信數據分析及可視化作圖(網絡)研討會2023年1月 已截止報名

    課程時間: 2023-01-07 09:00至 2023-01-08 18:00結束

    課程地點: 線上活動 

    主辦單位: 上海循掘生物科技中心

    行業熱銷熱門關注看了又看 換一換

          會議介紹

          會議內容 主辦方介紹


          R語言生信數據分析及可視化作圖(網絡)研討會2023年1月

          R語言生信數據分析及可視化作圖(網絡)研討會2023年1月宣傳圖

          R語言生信數據分析可視化作圖網絡研討會

          騰訊會議網絡會議室 202317-8

          會議簡介:

          眾所周知,R軟件是用來做數據分析和作圖的軟件。一篇高質量的文章,需要好的原始數據、邏輯的分析思路、漂亮的結果、創新的結論。其中,批量的分析操作會提高效率,美觀的圖片會讓人眼前一亮,刮目相看的。相同的數據,做出來的圖片可能大相徑庭。

          下圖就是由同一套數據所做的差異基因的表達聚類熱圖,孰優孰劣一目了然。

          R語言生信數據分析及可視化作圖(網絡)研討會2023年1月R語言生信數據分析及可視化作圖(網絡)研討會2023年1月

          R語言特點及優勢

          可以用來做生信分析及作圖的數據庫database、在線工具web-service、軟件software有很多,其中R軟件是一種適應性最廣、上手最快的工具??赡苡械娜藭幸蓡?,R語言是一種編程語言,我沒有任何計算機的基礎也適合使用R嗎?

          答案是可以的。原因是R軟件做分析及作圖,都有比較現成的R包及代碼。比如轉錄組分析相關的R包及代碼,可以用來做差異分析、火山圖、熱圖、PCA圖、WGCNA等。比如單細胞測序數據分析相關的R包及代碼,可以用來做細胞分型及聚類。還有RNA甲基化分析相關的、蛋白組代謝組相關的、臨床統計分析相關的R包及代碼。

          零基礎的是怎么快速掌握呢?以一個做熱圖的代碼為例子,雖然每個人的數據是不同的,但是只要拿到了做熱圖的代碼,我們就可以只是簡單的修改其中幾個參數,就可以輕松作出熱圖!我們只需要記住那幾個關鍵參數的含義及修改即可,而且,代碼中還有詳細的中文注釋!

          R語言生信數據分析及可視化作圖(網絡)研討會2023年1月

          當然,如果是我們自學就要花費更多的時間了。所以,我們開設了這次R語言實操班??梢酝ㄟ^老師系統的整理各個方向的生信代碼及實操,在短短的兩天一晚時間系統的掌握R分析的各種實操

          有很多學員也參加過醫藥加的其他培訓班,比如單細胞、比如RNA甲基化、TCGA、多組學、非編碼RNA等,它們也有一些R的操作及代碼。我們這次也會系統性的對這些班中的R代碼進行教學演練,希望大家帶著問題解決問題。

          專家簡介:宋博士

          成果:參與完成了近百篇軟件著作權和發明專利的撰寫和申請;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等數據庫的分析和構建;完成個體基因檢測流程和無創唐篩流程的開發。

          研究方向:有近十年的生信分析經驗,擅長方向有轉錄組測序分析、芯片數據分析、疾病機理研究分析、疾病預后與基因關聯分析、項目分析思路設計以及個性化分析等,精通perl、R等編程語言。


          會議預期:通過2天1晚的學習手把手教學讓學員掌握R軟件下載安裝、Rstudio用法、R語言常用作圖、R語言數據處理方法與編程技術、掌握R語言自主學習實踐的方法與技巧,現場解答學員在實際工作中遇到的有關技術問題,讓學員更好地掌握相關技術的應用。另外,課后學員有感興趣的圖片,老師也可以提供相應的R代碼。

          總體思路是根據生信相關的SCI熱點文章為主題,完成里面相關的分析及作圖。該培訓適用于對生信分析或者醫學統計學分析感興趣,編程零基礎及以上的學員參加。


          會議詳細日程


          R語言生信數據分析及可視化作圖日程

          課程

          內容

          第一天

          上午

          R語言——編程環境、數據結構、語法和練習

          R軟件的歷史、簡介、優缺點

          R編程形式與資源

          R軟件的安裝

          Rstudio使用技巧及安裝

          R語言的數據結構(元素、向量、矩陣)

          R語言的編程方法

          一起練——R語言的編程練習

          第一天

          下午

          生信參考文獻解讀

          生信文獻的流程解讀

          常用的生信分析流程

          流程模塊使用的R包及函數簡介

          案例展示

          常用R函數

          統計編程思想與流程

          數據描述性分析R實現

          統計分析R實現

          實戰操作演練——卡方檢驗、回歸分析、方差分析、Fisher精確檢驗、相關性分析等

          第一天

          晚上

          常用R包(1

          轉錄組、蛋白組、表觀組、代謝組等不同組學數據差異基因篩選及可視化

          R包的介紹——r-project 來源及 Bioconductor 來源

          R包的安裝——在線安裝及本地安裝方法

          芯片數據預處理——標準化,歸一化

          差異分析——差異基因篩選,火山圖

          無監督聚類分析——PCA分析,聚類熱圖分析

          第二天上午

          常用R 包(2

          基因、蛋白相關分析

          R語言功能富集分析,包括KEGG pathway,以及GO BP, CC, MF分析,功能條形圖,功能氣泡圖可視化

          共表達分析——pearson法,相關性散點圖

          生存預后分析——KM曲線圖,添加p值,HR

          樣本相關性及相關性熱圖分析

          實操

          第二天下午

          常用R包(3

          常見思路

          單細胞測序相關分析

          RNA甲基化相關分析

          時間序列分析——多組連續樣本的基因表達聚類

          實操

          R語言學習的方法與技巧

          算法思想、R包及函數用法、參數說明、范例程序

          如何找到有用的R資源

          R語言學習小竅門

          互動環節與答疑





          PS:必須攜帶電腦,最好是win10系統,蘋果系統需自己安裝好R和Rtudio軟件。會后主辦方會統一提供全程錄像作為復習資料。



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          通過該培訓,可以學會R語言基礎(輸入文件格式、輸出文件格式、操作代碼的參數調整)、統計學上各種算法的實現、SCI常用圖片生成等,例如:

          具體示例可添加微信客服HDJVIPKEFU查看。?

          查看更多

          上海循掘生物科技中心

          上海循掘生物科技中心于2020年2月21日舉辦TCGA&GEO生信高通量數據挖掘分析研討會2020(2月深圳班)會議。

          會議日程


          即將更新,敬請期待

          會議嘉賓


          即將更新,敬請期待

          參會指南

          會議門票


          會務費用3000元

          優惠政策

          1. 提前報名并付款的,可以預先拿到學習資料

          2. 三人組團報名,每人優惠100

          開具正規會務費發票,提供紙質蓋章邀請函

          時間2023年1月7-8日(2天一夜

          第一天 白天 9:00-17:30,晚上 19:00-22:00

          第二天 白天 9:00-17:30

          地點:騰訊會議網絡會議室

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          查看更多

          溫馨提示
          酒店與住宿: 為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后,再安排出行與住宿。
          退款規則: 活動各項資源需提前采購,購票后不支持退款,可以換人參加。

          還有若干場即將舉行的 R語言大會

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          部分參會單位

          主辦方沒有公開參會單位
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