Python生物信息從入門到進階研討會2023年2月培訓班
時間:2023-02-03 09:00 至 2023-02-05 18:00
地點:線上活動
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Python生物信息從入門到進階研討會2023年2月培訓班 已截止報名課程時間: 2023-02-03 09:00至 2023-02-05 18:00結束 課程地點: 線上活動 主辦單位: 上海循掘生物科技中心
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會議介紹
會議內容 主辦方介紹
Python生物信息從入門到進階研討會2023年2月培訓班宣傳圖
2023年2月3-5日 騰訊會議網絡會議室
【課程背景】Python是一種結合解釋性、編譯性、互動性和面向對象的腳本語言。它設計簡潔,具有很強的可讀性。Python目前擁有眾多專用的科學計算擴展庫,以及生物信息學專用的Biopython,為分析處理生物信息學數據提供了強大功能。越來越多的科研人員開始學習Python語言用于機器深度學習,來處理實驗數據、制作圖表。
【課程特色】
1. 本課程覆蓋python基礎知識,通過atom程序編輯軟件進行python程序寫作。
- Deep learning,決策樹,支持向量機,神經網絡
3. Github程序庫介紹,Git使用下載、上傳、協作軟件編輯,
4. Python基本軟件包Numpy、Pandas、Matplotlib、SKlearn及磁共振軟件包nibabel介紹
5. 本課程手把手,實操性強,有全程屏幕錄制視頻課后發給學員,組群學員微信群便于學員與講師互動交流
【講師背景】
專家,博士生導師。研究方向生物物理、生物光子學、生物醫學虛擬場景開發。05獲中科院分子發育生物學碩士學位,08年獲美國東北大學物理化學碩士學位,13年獲美國密蘇里大學哥倫比亞生物物理博士學位與統計碩士學位,13-18年在加州大學伯克利分校博士后。目前已在Cell,Nature Communications,EMBO reports,ACS Sensors等雜志發表文章十余篇。
【主要內容】詳細內容見課表
Git軟件使用、Python編程詳解
【學習目標】
通過學習,讓學員掌握:Git、Atom的基本使用、python數據結構;python的輸入輸出、方程、模塊、循環、算法、尋找bug;python常見軟件包numpy、pandas、matplotlib、SKlearn、nibabel等安裝使用及軟件包功能介紹;通過python進行小的數據、圖像、數學、統計計算分析;python深度學習介紹,人工智能訓練線性及卷積神經網絡。
培訓時間:2023年2月3-5日,2日晚上有預備課,指導軟件安裝。
培訓地點: 騰訊會議
地點:騰訊會議網絡會議室
主辦方:上海循掘生物科技中心
收費標準:
3800元/人, 注冊費包含教材、但不包括住宿費和晚餐。
優惠措施:提前報名并付費可以提前拿到學習資料
3人組團,每人優惠100元,4人組團,每人優惠200元
6人組團,可免一人注冊費(即只交5個人的費用)
參加復聽的學員,每人只需交600元費用(可以這次一起向單位多申請600元)
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以下為詳細日程:
Python學習班課程安排 | |||
日期 | 時間 | 主要內容 | 詳細內容 |
備課 | 19:00-20:30 | 軟件安裝 | Git、Atom、Python安裝 |
第一天上午 | 9:00-10:30 | 計算機語言基本介紹 | 計算機語言介紹、不同語言比較、Python的優缺點、Github介紹 |
程序的組織與寫作、Git介紹 | |||
基本數學計算、變量、字符、文字 | |||
交互式輸入與輸出、上載與下載文件 | |||
10:30-10:45 | |||
10:45-12:00 | 計算機語言數據結構與邏輯教學 | 交互式輸入與輸出、上載與下載文件 | |
循環與邏輯 | |||
數據結構:序列和字典 | |||
12:00-13:00 | 午休時間 | ||
第一天下午 | 13:00-15:30 | 編程基本講解與Python軟件包教學 | 面向對象編程 |
模塊、類與對象 | |||
Python軟件包,如何制作并使用 | |||
Debugging、自測試 | |||
15:30-15:45 | |||
15:45-18:00 | 基本程序寫作及網絡數據挖掘寫作 | Python統計計算,均值、方差、t統計、p值、pdf和cdf統計分布圖 | |
基本網絡數據挖掘寫作 | |||
第二天上午 | 9:00-10:30 | Matplotlin軟件包及實操(一) | Matplotlin軟件包介紹 |
現狀圖、柱形圖、散點圖、 | |||
輪廓圖、圖像保存 | |||
一般圖像的輸入、輸出 | |||
10:30-10:45 | 休息 | ||
10:45-12:00 | Matplotlin軟件包及實操(二) | 矩陣基礎、數字圖像是什么? | |
基本圖像數字處理、平移、縮放、旋轉 | |||
Affine轉化、圖像切割、多圖繪制 | |||
12:00-13:00 | 午休時間 | ||
第二天下午及晚上 | 13:00-15:30 | Numpy軟件包介紹及實操(一) | Numpy軟件包介紹、數組屬性 |
創建數組、數值性質、切片索引 | |||
高級索引 | |||
15:30-15:45 | 休息 | ||
15:45-18:00 | Numpy軟件包介紹及實操(二) | 廣播、數組迭代 | |
數組操作、位運算、字符串函數 | |||
數學函數、統計函數、基礎統計介紹 | |||
矩陣庫、線性代數運算 | |||
18:00-19:00 | 晚飯及休息時間 | ||
19:00-22:00 | mxnet軟件包介紹及實操 | 線性神經網絡、softmax回歸 | |
圖像分類MNIST | |||
多層感知機 | |||
深度學習計算,卷積神經網絡 | |||
第三天上午 | 9:00-10:30 | Pandas軟件包介紹及實操 | Pandas軟件包介紹 |
選擇數據、設置值處理、數據丟失、合并出圖 | |||
全基因組sgRNA數據的分析、sgRNA序列提取、GC含量、sgRNA位置信息提取、sgRNA序列比對 | |||
10:30-10:45 | 休息 | ||
10:45-12:00 | Biophython軟件包介紹及實操 | 基因序列管理、比對 | |
DNA序列轉錄、翻譯 | |||
多序列比對、序列輸入輸出 | |||
Nibabel軟件包及實操 | Nibabel軟件包介紹 | ||
磁共振MRI數據讀取 | |||
矩陣提取、結果可視化、運動矯正、線性回歸 | |||
磁共振MRI數據讀取 | |||
12:00-13:00 | 午休時間 | ||
第三天下午 | 13:00-15:00 | Scikit learn軟件包及實操 | 矩陣提取、結果可視化、運動矯正、線性回歸 |
線性回歸 | |||
分類、無監督 | |||
數據降維、數據預處理、PCA、K-means、支持向量機SVM、決策樹 | |||
15:00-15:15 | |||
15:15-17:00 | Tensorflow深度學習介紹 | 卷積、正向反向傳播、優化器、損失函數、池化、BN | |
LeNet, AlexNet, VGGnet, Inception, ResNet網絡介紹與應用 | |||
圖網絡與超圖網絡介紹 | |||
備注:務必自帶電腦,要求windows系統,有大于50G可用內存。學習班可提供安裝包 | |||
醫藥加金牌學習班特色:
醫藥加金牌學習班自2017年1月正式開辦以來,已經成功舉辦了千余期,培訓了全國(包涵港、澳、臺地區)及加拿大、丹麥、澳大利亞等國家超過千家科研單位的近萬名學員。良好的課堂氛圍和講師耐心的課后跟進,獲得了學員的交口稱贊。醫藥加金牌學習班,是讓學員們真正能夠學以致用,在科研上更上一層樓的學習班。
學習班教學宗旨:教得多,講得精,學得會,用得上。
講師團隊:醫藥加金牌學習班所有講師都來自于科研一線,博士以上學歷,高級職稱,具有豐富的實戰經驗和講課經驗,保障了學習班的內容的實用性、趣味性。
課程內容:課程內容為講師親自設計,以科研工作者切身需求為出發點,將課程方向與當前熱點完美結合。全程純干貨、無套路。
課堂效果:小班制教學,講師面對面授課,互動性強,答疑時間充足,有問題現場解決。上課PPT完全拷給學員。
課后保障:組建長期微信群,講師與學員可長期互動。也方便學員之間聯系,進行橫向合作。了解最新課程安排。
實際效果:很多上過學習班學員,已經反饋成功發表文章,基金中標。
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上海循掘生物科技中心于2020年2月21日舉辦TCGA&GEO生信高通量數據挖掘分析研討會2020(2月深圳班)會議。
會議日程
會議嘉賓
參會指南
會議門票
票種名稱 | 價格 | 原價 | 票價說明 |
會務費 | ¥3800 | ¥ |
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溫馨提示
酒店與住宿:
為防止極端情況下活動延期或取消,建議“異地客戶”與活動家客服確認參會信息后,再安排出行與住宿。
退款規則:
活動各項資源需提前采購,購票后不支持退款,可以換人參加。
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