科研作圖班課程安排

日期

時間

內容安排

第一天上午

8:00-9:00

軟件安裝Origin, ImageJ, Adobe Illustrator, UCSF Chimera。

9:05-10:00

Origin數據導入，如何根據任何方程導入新數據，根據行與列進行統計分析，如每一列的均值、方差、均值方差等。

10:05-11:00

Origin內數據的線性和非線性擬合，藥物靶點結合競爭與非競爭性分析。根據任何已知方程對實驗數據的模擬，柱狀圖和線型圖制作及error bar畫法。圖與原始數據的對應。

11:05-12:00

Origin數據圖格式修改、顏色修改、數據區間修改、橫坐標線性到指數修改、坐標軸大小設置、標記修改。

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12:00-13:30

統一午餐

第一天下午

13:30-14:30

Adobe illustrator畫圖優勢、畫板概念、層（layer）概念、添加及刪除畫板和層、畫板和層大小設置、畫板內的分格。

14:35-15:30

Selection和direct selection工具差別及使用、標準形狀物體的畫法、標準形狀通過pathfinder整合成多樣不規則形狀物體、顏色樣品板swatches設置、eyedropper工具使用、pencil與pen工具使用、顏色梯度使用。

15:35-17:00

Origin圖表如何導入illustrator、圖表在illustrator內的修改對齊、坐標軸粗細調整、標記重拍對齊、圖表層內對齊、代表論文內的制圖訓練；細胞信號轉導通路模式圖和實驗路線圖制作。

17:00-18:00

基金標書與高分文章用的分子機理模式圖的制作

晚上

18:30-20:00

作圖實操串聯加強訓練

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第二天上午

9:00-10:00

ImageJ界面介紹、識別格式，圖像和小電影的保存，圖像對比度調整、圖像序列堆疊與解堆疊、堆疊圖像到montage轉換、去除和提取圖像序列或者小電影中特定的一幀或者幾幀圖像、圖像crop、圖像區間選取及強度面積計算、凝膠電影條帶強度計算。

10:05-11:00

熒光顯微鏡照片標尺scale bar放置及大小設置、圖像平滑處理及背景去除、plungin的安裝使用、time series的分析、圖像內任意切線的強度分布圖。

11:05-12:00

ImageJ plugin的介紹及java編寫imageJ plugin簡單介紹、循環操作如何生成batch script（群操作腳本語言）。

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12：00-13：30

統一午餐

第二天下午

13:30-14:30

蛋白結構解析方法介紹及如何用UCSF chemira顯示蛋白結構、PDF文件格式及內容介紹、結構圖像導-出。

14:35-15:30

Snapview軟件演示，蛋白質數據庫講解及pdb數據格式介紹。

15:35-17:00

通過最新發表文章圖講解理解科研作圖基本規則，不同類型文章圖制作流程，如何highlight圖上重要的區域或者數據點。

PS:務必攜帶電腦，要求windows系統。MAC請提前做好雙系統或自己裝好上課軟件

軟件安裝Origin, ImageJ,Adobe Illustrator,UCSF Chimera, 3Dmax